上海至合肥物流运输投资额与投资效益也是影响企业物流方案的重要因素，在方案初步完成后，需要对其进行效益分析。对于以储存为主的仓库来说，其效益主要体现在单位储位的成本。将建筑投资、人力成本、设备投资总额相加，除以总储位数，即可以得到每个储位占用的资金额，以此来比较不同方案的优劣。对于以配送为主的配送中心来说，效益分析就相对复杂，需结合作业方式来考虑，除评估每个储位的成本外，还要计算方案所能达到的单位时间处理能力。由一些辅助软件可以帮助计算。
　　之前所做的所有工作，可以说是一种基于理论与经验的总结，上海至合肥物流运输在付诸实施之前，还应该进行现场作业模拟，以验证其可行性。模拟最好是在作业面的人员配合之下进行，因为他们是系统的具体执行者，对产品状况、企业运作模式最为了解，也容易发现系统中的缺陷与不足，方便物流方案设计者进行修正。现在也有相关的仿真模拟软件，但大多数用　于集装箱码头等大型货场。
　　在设计MES仓储物流方案时还有一些需要注意的地方，如提出方案的时间，许多的厂商在建筑设计完成后，已经开始土建时再开始考虑仓储方案，由于柱距等影响，往往会造成空间浪费，因此最好的时间应该在土建之前。再如对方案弹性的考虑，好的设计应该是有一定扩充能力的，摆的满满的仓库通常效率都比较低。再如对货物流动尖峰期的考虑，设计能力是否能够满足高峰期的要求等等，都应该纳入考虑范围之内。
作为仓库来说，其目标无非是增加有限空间内的存储量，提高空间利用率或者加快周转速度，缩短库存周期，但是这些目标并非在任何时候都可以完全满足的，有时相互之间还存在着一定的冲突，此时就需要有一个平衡点，来权衡如何取舍。目标设定后，还需要与相关的各部门沟通，尤其是　使用单位，新的目标，新的方式必定会打破旧的作业模式，因此让使用者了解新方案的目的，支持新方案，将大大有助于方案的实施。

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